MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	GA	3	6	3	8	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022602	GAAA	2	8	39	46	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022602	AATC	2	8	55	62	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022602	GAA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022602	AGC	2	6	101	106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022602	TTG	2	6	125	130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022602	A	6	6	153	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022602	AATGCA	2	12	199	210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022602	TGT	2	6	213	218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022602	GTTC	2	8	268	275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022602	A	8	8	290	297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022602	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022602	CTA	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022602	AGA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022602	TTGA	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022602	TAG	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022602	TAT	2	6	514	519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022602	AGA	2	6	606	611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022602	ACT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022602	CAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022602	GTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022602	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022602	A	7	7	710	716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022602	AGT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022602	A	6	6	822	827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022602	AAGA	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022602	TAT	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022602	GAT	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022602	CTT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022602	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022602	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022602	AAAG	2	8	1015	1022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022602	AGA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022602	CAA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022602	GCT	2	6	1120	1125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022602	TCT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022602	TGAG	2	8	1139	1146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022602	TAA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022602	ACTG	2	8	1221	1228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022602	A	6	6	1256	1261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022602	CAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022602	TTG	2	6	1309	1314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022602	ATT	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022602	GAA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022602	AAGAAA	2	12	1394	1405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022602	TTC	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022602	AATTT	2	10	1503	1512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022602	T	6	6	1510	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022602	GTA	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022602	AGA	2	6	2248	2253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022602	TATG	2	8	2265	2272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022602	TTA	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022602	TA	3	6	2281	2286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022602	AGAT	2	8	2288	2295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022602	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022602	TA	3	6	2311	2316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022602	T	7	7	2322	2328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022602	T	6	6	2330	2335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022602	GGA	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022602	AAG	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022602	AAG	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022602	GA	3	6	4372	4377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022602	AGG	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022602	GGA	2	6	9391	9396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022602	TGA	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022602	AT	3	6	12774	12779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022602	AAT	2	6	12780	12785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022602	A	7	7	12824	12830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022602	AAT	2	6	12884	12889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022602	CAT	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022602	ATT	2	6	15404	15409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022602	CTA	2	6	15429	15434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022602	TA	3	6	15458	15463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022602	ACTA	2	8	15531	15538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022602	ATT	2	6	15642	15647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022602	A	7	7	15676	15682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022602	TA	3	6	15684	15689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022602	A	8	8	15689	15696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022602	TCC	2	6	16569	16574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_022602	T	6	6	16598	16603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022602	TAT	2	6	16606	16611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022602	AT	3	6	16610	16615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022602	AGAA	2	8	16631	16638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022602	A	7	7	20367	20373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022602	A	7	7	20403	20409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022602	GAT	2	6	20410	20415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022602	A	9	9	20419	20427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022602	A	7	7	20464	20470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022602	T	6	6	20471	20476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022602	CAG	2	6	20499	20504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022602	T	8	8	20515	20522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022602	CTT	2	6	20525	20530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022602	ATA	2	6	20560	20565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022602	ATTA	2	8	20593	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022602	AAGA	2	8	20604	20611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022602	ATA	2	6	20612	20617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022602	GAA	2	6	20624	20629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022602	GA	3	6	20630	20635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022602	ATA	2	6	20641	20646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022602	ATG	2	6	20657	20662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022602	ATT	2	6	20668	20673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022602	A	7	7	20680	20686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022602	TA	3	6	20695	20700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022602	A	6	6	20705	20710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022602	TAT	2	6	20728	20733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022602	TAA	2	6	21308	21313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022602	TATT	2	8	21319	21326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022602	AAGTC	2	10	21348	21357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022602	CCT	2	6	22583	22588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022602	AACA	2	8	22684	22691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022602	TA	3	6	22720	22725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022602	ATT	2	6	22769	22774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022602	TCT	2	6	22786	22791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022602	TTG	2	6	22843	22848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022602	TAA	2	6	24112	24117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022602	AATTTT	2	12	24137	24148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022602	TCT	2	6	24808	24813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022602	ATT	2	6	24814	24819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022602	AT	3	6	24820	24825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022602	AAT	2	6	24830	24835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022602	T	7	7	24867	24873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022602	ACTT	2	8	24893	24900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022602	T	7	7	24899	24905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022602	GAAA	2	8	24994	25001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022602	T	6	6	25006	25011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022602	GA	3	6	26344	26349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022602	GTTTA	2	10	26362	26371	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022602	AAT	2	6	26437	26442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022602	ATT	2	6	26486	26491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022602	AT	3	6	26505	26510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022602	TAA	2	6	26512	26517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022602	ATT	2	6	26561	26566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022602	TAA	2	6	26640	26645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022602	AAT	2	6	26737	26742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022602	ATA	3	9	26782	26790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022602	ATA	2	6	31819	31824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022602	TA	3	6	31823	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022602	TGAT	2	8	31842	31849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022602	TTAA	2	8	31858	31865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022602	AC	3	6	31884	31889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022602	A	7	7	31891	31897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022602	A	8	8	31939	31946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022602	GAA	2	6	31949	31954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022602	CCT	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_022602	CCT	2	6	34147	34152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_022602	ATA	2	6	34200	34205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022602	TAC	2	6	34216	34221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_022602	T	7	7	34431	34437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022602	T	6	6	34491	34496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022602	TGT	2	6	34577	34582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022602	A	8	8	34596	34603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022602	A	7	7	34660	34666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022602	ACA	2	6	34691	34696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_022602	ATT	2	6	34698	34703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022602	T	6	6	34755	34760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022602	TG	3	6	34780	34785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022602	CGC	2	6	34819	34824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_022602	TGG	2	6	34907	34912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022602	ACA	3	9	34998	35006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_022602	CGA	2	6	35008	35013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_022602	AT	3	6	35057	35062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022602	CAC	2	6	35135	35140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_022602	TC	3	6	35143	35148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_022602	TATT	2	8	35189	35196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022602	AATG	3	12	35235	35246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022602	AAT	2	6	35255	35260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_022602	A	7	7	35338	35344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022602	TAA	2	6	35355	35360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022602	A	7	7	35359	35365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022602	ACT	2	6	35380	35385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_022602	AGG	2	6	35396	35401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022602	TATT	2	8	36081	36088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022602	GATTGA	2	12	36094	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022602	AGA	2	6	36109	36114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022602	GGA	2	6	36117	36122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022602	T	6	6	36924	36929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022602	TGA	2	6	36950	36955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022602	CAT	2	6	37049	37054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_022602	TAT	2	6	37085	37090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022602	AGGG	2	8	37131	37138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022602	A	6	6	37140	37145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022602	TTA	2	6	39752	39757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_022602	TTG	2	6	39774	39779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022602	AAT	2	6	39800	39805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022602	TTA	2	6	39817	39822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022602	AT	3	6	39823	39828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_022602	AAC	2	6	39902	39907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_022602	TCG	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_022602	AT	3	6	40603	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022602	AT	3	6	40617	40622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022602	TTA	2	6	40684	40689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022602	T	8	8	40697	40704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022602	TTAA	2	8	40710	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022602	TAA	2	6	40734	40739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_022602	CTT	2	6	41765	41770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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205	NC_022602	T	8	8	41829	41836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.